Des analyses rétrospectives de preuve de concept réalisées à partir de médicaments anticancéreux déjà commercialisés démontrent la pertinence clinique des prédictions de la plateforme de pharmacogénomique de précision (PGx).
La plateforme exclusive de pharmacogénomique de précision (PGx) permet d’identifier rapidement de nouvelles options thérapeutiques pour les cancers associés à des mutations avec perte de fonction (LOF).
Une approche novatrice reposant sur le criblage pharmacogénétique in vitro de molécules en phase clinique pour cibler les principaux marchés des tumeurs solides
San Mateo (Californie), le 5 septembre 2024 — Leapfrog Bio, une société d’oncologie de précision au stade clinique qui accélère le développement de médicaments en oncologie en identifiant de nouvelles thérapies pour des mutations oncogéniques difficiles à cibler, a annoncé aujourd’hui la publication d’un article dans la revue npj Precision Oncology (Nature Portfolio) décrivant et validant sa plateforme de pharmacogénomique de précision (PGx). Cette approche novatrice permet de cribler et d’identifier des combinaisons médicament–génotype cliniquement exploitables, susceptibles d’avoir un impact significatif sur la survie globale des patients atteints de cancer. La plateforme évalue des cancers associés à des mutations avec perte de fonction (LOF) et s’appuie sur la biologie réelle des mutations conductrices pour révéler des vulnérabilités jusqu’ici inexplorées, puis identifier les traitements capables de les exploiter afin d’éliminer les cellules cancéreuses.
Comme décrit dans l’article, l’approche repose sur des criblages CRISPR centrés sur les mutations conductrices, réalisés en présence et en absence de médicament dans un ensemble de lignées cellulaires isogéniques contrôlées. Le séquençage de nouvelle génération (NGS) est utilisé pour identifier les gènes dont la mutation entraîne la disparition des cellules du pool lorsqu’elles sont traitées avec un médicament donné. Des expériences de preuve de concept utilisant des inhibiteurs de PARP (poly(ADP-ribose) polymérase) — la seule classe de médicaments actuellement ciblant les cancers associés à des mutations avec perte de fonction — ont permis à l’équipe d’optimiser techniquement son approche pharmacogénétique. La plateforme a ensuite été appliquée à des médicaments anticancéreux approuvés pour lesquels des données du monde réel étaient disponibles, démontrant que les sensibilisateurs génétiques identifiés par la plateforme ont un impact sur la survie des patients.
« Ce fut un moment déterminant pour moi », déclare Tomas Babak, Ph. D., directeur scientifique de Leapfrog Bio et auteur correspondant. « Non seulement nous avons observé une validation à 100 % dans des modèles de xénogreffes murines, mais notre plateforme a également permis d’identifier quels patients étaient les plus susceptibles de répondre à des traitements spécifiques en fonction des facteurs génétiques à l’origine de leurs tumeurs. Contrairement aux approches traditionnelles de létalité synthétique, fondées sur des combinaisons d’invalidations génétiques, les interactions pharmacogénomiques permettent de capter les effets des médicaments, qui peuvent être bien plus complexes qu’une simple invalidation génique. »
« Les deux tiers des cancers sont liés à des mutations avec perte de fonction affectant des gènes suppresseurs de tumeurs, où l’absence de protéine fonctionnelle entraîne la croissance tumorale », a déclaré Greg Vontz, chef de la direction de Leapfrog Bio. « En raison de la difficulté à développer des thérapies ciblées pour des maladies causées par l’absence d’une protéine cible, la majorité des patients atteints de ces cancers n’ont pas accès à des traitements génétiquement ciblés. Notre plateforme de pharmacogénomique de précision (PGx) répond à cet important besoin non satisfait pour les patients et les cliniciens. »
M. Vontz a poursuivi : « Plus de 2 400 thérapies anticancéreuses en phase clinique n’ont pas obtenu l’approbation de la FDA en raison d’un manque d’efficacité, bien qu’elles aient généralement démontré un bon profil d’innocuité et de tolérance. Après avoir analysé seulement une fraction de ces molécules, Leapfrog a identifié plusieurs opportunités prometteuses et a déposé des demandes de propriété intellectuelle correspondantes liées à ces découvertes. »
À propos de Leapfrog Bio
Leapfrog Bio est une société d’oncologie de précision au stade clinique qui accélère le développement de médicaments contre le cancer en identifiant des molécules déjà en phase clinique pouvant être repositionnées comme thérapies ciblées pour des cancers associés à des mutations conductrices difficiles à cibler.
Son principal programme consiste en un essai de preuve de concept de phase 2 évaluant une petite molécule dans trois cancers solides présentant une mutation génétique avec perte de fonction fréquente, pour laquelle il n’existe actuellement aucune option thérapeutique ciblée.
La plateforme de pharmacogénomique de précision (PGx) de Leapfrog Bio constitue un système in vitro reproductible et évolutif permettant d’identifier des médicaments à petites molécules existants pouvant être développés pour traiter des cancers liés à des mutations avec perte de fonction, avec une forte probabilité de succès clinique.
Cette plateforme, validée en clinique, est décrite dans l’article évalué par des pairs intitulé « Pharmacogenomic Discovery of Genetically Targeted Cancer Therapies Optimized Against Clinical Outcomes », publié dans la revue npj Precision Oncology (Nature Portfolio). Pour en savoir plus, visitez www.leapfrog.bio.
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